死人が生者を喰らう世界。
死者の魂を天に還し死の安らぎを与えることを使命とする「葬儀師」。
不死者と人間のハーフで見習いのレオンは、葬儀師になるための最終試験に向かう列車の中で何者かに追われる少女エレナと出会う。
彼女を助けたことでレオンは、共に追われる身となってしまう。
逃避行の最中にふたりは墓守のモイラと出会うのだが、未熟なレオンにモイラはきつく当たる。
そんな中、埋めたはずの遺体が死霊化する事態が発生しー…？？